Tuy FBI không công bố nguyên nhân cũng như thời điểm bắt đầu tiến hành cuộc điều tra này, song giới truyền thông cho rằng các công tác điều tra đã được xúc tiến một cách bí mật từ nhiều tháng nay tại 2 trụ sở của Quỹ Clinton ở Little Rock và Arkansas.
Ông Nick Merrill, phát ngôn viên của bà Hillary, nói với rằng cuộc điều tra là "một sự giả dối", cáo buộc Bộ trưởng Tư pháp Mỹ Jeff Sessions đang thực hiện lệnh của Tổng thống Donald Trump khi theo đuổi vụ việc. Ông Trump từng kêu gọi điều tra Quỹ Clinton trong chiến dịch tranh cử tổng thống Mỹ hồi tháng 8/2016.
Mới đây, Tổng thống Trump đã chỉ trích Bộ Tư pháp khi chưa bỏ tù Huma Abedin - nhân viên của cựu ngoại trưởng Hillary Clinton khi gửi thông tin bảo mật vào email cá nhân. Phê phán gay gắt mới xuất hiện sau khi ông Trump liên tục "tấn công" FBI và những đặc vụ làm việc cùng công tố viên Robert Mueller, người đang điều tra mối liên hệ giữa chiến dịch tranh cử của ông Trump và Nga.
Phe Dân chủ cáo buộc cuộc điều tra này của đảng Cộng hoà là nhằm đánh lạc hướng dư luận với cuộc điều tra về sự liên quan giữa chiến dịch tranh cử của ông Donald Trump với các quan chức Nga. Trong cuốn sách mới đầy chấn động “Lửa và cuồng nộ - Bên trong Nhà Trắng của Trump” của tác giả Michael Wolff, cựu chiến lược gia trưởng của Nhà Trắng Steve Bannon đã tiết lộ về cuộc gặp hồi tháng 6/2016 giữa con trai ông Trump là Donald Jr, con rể Jared Kushner, quản lý chiến dịch tranh cử Paul Manafort cùng luật sư người Nga Natalia Veselnitskaya ở Tháp Trump tại New York. Nữ luật sư trong email giới thiệu tự xưng cô là "luật sư của chính phủ Nga" và có thông tin nhạy cảm về bà Hillary Clinton. Báo New York Times hồi tháng 7/2017 cũng đã phanh phui về việc này.