Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội quy định công tác tuyển sinh những trường này gồm 2 vòng kết hợp xét tuyển và kiểm tra, đánh giá năng lực. Học sinh đăng ký tuyển sinh vào trường trải qua 3 bài kiểm tra, đánh giá năng lực các môn Toán, Tiếng Việt và Tiếng Anh với thời lượng mỗi môn 45 phút. Hình thức kết hợp trắc nghiệm khách quan và tự luận.
Đối với những trường được TP Hà Nội công nhận trường chất lượng cao, tuyển sinh vào lớp 6 không theo tuyến và có số lượng học sinh vượt quá chỉ tiêu, năm học 2019-2020 cũng được Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội cho phép tuyển sinh theo phương thức xét tuyển hoặc xét tuyển kết hợp với kiểm tra, đánh giá năng lực.
Cụ thể, điểm tuyển sinh được tính bằng điểm xét tuyển cộng với điểm kiểm tra (nhân hệ số 2). Căn cứ vào kết quả rèn luyện và học tập của học sinh ở cấp tiểu học và diện ưu tiên của học sinh, các trường THCS xây dựng phương án xác định điểm xét tuyển của học sinh. Điểm xét tuyển tính theo thang điểm 10.
Trường THPT chuyên Hà Nội – Amsterdam công bố phương án tuyển sinh trong đó kết hợp giữa xét tuyển và đánh giá năng lực. Cụ thể: Học sinh đạt học lực giỏi từ lớp 1, 2; hoàn thành các môn học lớp 3-5 và được đánh giá là học sinh xuất sắc; tổng điểm bài kiểm tra định kỳ cuối năm 2 môn Tiếng Việt và Toán trong các năm lớp 1-5 đạt 19 điểm trở lên. Hạnh kiểm học sinh lớp 1-2 đạt thực hiện đầy đủ các nhiệm vụ của học sinh; lớp 3-5 phần đánh giá năng lực và phẩm chất phải được đánh giá đạt.
Trường cũng đánh giá năng lực những học sinh đã qua các điều kiện xét tuyển bằng ba bài kiểm tra, đánh giá năng lực các môn toán, tiếng Việt và tiếng Anh, thời lượng mỗi môn 45 phút theo hình thức kết hợp trắc nghiệm và tự luận.
Trường chuyên THPT Hà Nội Amsterdam tính điểm khuyến khích cho học sinh được tặng bằng khen cấp thành phố, Bộ Giáo dục và Đào tạo, Nhà nước; học sinh đạt thành tích cá nhân và đồng đội theo quy định của Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội về thông tin các cuộc thi, Olympic dành cho học sinh phổ thông. Điểm xét tuyển được tính bằng tổng điểm học tập từ lớp 1 đến lớp 5 và điểm ưu tiên, khuyến khích. Học sinh trúng tuyển nếu đạt điểm xét tuyển theo thứ tự từ cao xuống thấp đến khi đủ chỉ tiêu. Trường hợp học sinh đạt điểm xét tuyển trùng nhau, hội đồng tuyển sinh sẽ xét tổng điểm khuyến khích của toàn bộ giải thưởng cá nhân đạt được trong các lớp 1-5 và xếp thứ tự từ cao xuống thấp cho đến khi đủ chỉ tiêu.
Trường THCS Nguyễn Siêu lại đưa ra ưu tiên đối với những học sinh đã học lớp 5 trong hệ thống Nguyễn Siêu. Học sinh cần có trình độ tiếng Anh phù hợp với yêu cầu, mục tiêu của chương trình quốc tế. Nếu học sinh không có chứng chỉ tiếng Anh thì bắt buộc phải tham gia bài kiểm tra đánh giá năng lực tiếng Anh tương đương trình độ yêu cầu.
Trường cũng ưu tiên học sinh đạt từ giải 3 trở lên với các môn học thuật trong các cuộc thi do Bộ Giáo dục và Đào tạo tổ chức (từ cấp thành phố). Nhà trường sẽ xét học bổng cho học sinh đạt thành tích cao ở tiểu học và có giải thưởng quốc gia, quốc tế hoặc có điểm thi Checkpoint Primary đạt 6/6 các điểm thành phần các môn thi.
Trường THCS Cầu Giấy là một trong 7 trường triển khai thí điểm đào tạo Chương trình song bằng THCS Việt Nam và chứng chỉ IGCSE Cambridge. Học sinh phải thực hiện hai bài kiểm tra: Bài kiểm tra tiếng Anh và bài kiểm tra môn toán bằng tiếng Anh theo chuẩn CAIE. Điểm tuyển sinh được tính bằng tổng điểm các bài kiểm tra. Quy trình xét tuyển của trường được thực hiện như sau: Quy đổi điểm từng bài kiểm tra của thí snh về thang điểm 10; Tính điểm tuyển sinh của mỗi thí sinh là tông điểm 2 bài kiểm tra. Sắp xếp danh sách thí sinh thứ tự ưu tiên, điểm tuyển sinh và nguyện vọng đăng ký dự tuyển.
Trường THCS Lương Thế Vinh tuyển sinh theo hình thức khảo sát đánh giá năng lực. Trường đưa ra yêu cầu học sinh phải đạt 5 năm học lực giỏi, hoặc đạt 9 điểm trở lên trong bài kiểm tra định kỳ cuối năm Tiếng Việt và Toán của lớp 4 và lớp 5. Tổng điểm môn Toán, tiếng Việt ở 5 năm tiểu học có tối đa 100 điểm. Học sinh phải thực hiện đầy đủ nhiệm vụ của bậc tiểu học, được đánh giá Đạt về phẩm chất và năng lực trong lớp 4, lớp 5.
Những trường được Hà Nội cho phép triển khai thí điểm đào tạo Chương trình song bằng THCS Việt Nam và chứng chỉ IGCSE Cambridge tại trường THCS trên địa bàn thành phố tuyển sinh theo phương thức kiểm tra, đánh giá năng lực. Thí sinh thi vào trường sẽ phải thực hiện 2 bài kiểm tra, đánh giá năng lực môn tiếng Anh và môn Toán bằng tiếng Anh. Các bài kiểm tra của học sinh được quy đổi về thang điểm 10. Điểm tuyển sinh là tổng điểm của hai bài kiểm tra.
Đó là các trường: THCS Chu Văn An (quận Tây Hồ), THCS Thanh Xuân (quận Thanh Xuân); THCS Cầu Giấy (quận Cầu Giấy), THCS Nghĩa Tân (quận Cầu Giấy); THCS Trưng Vương (quận Hoàn Kiếm), THCS Ngô Sĩ Liên (quận Hoàn Kiếm) và lớp 6 THCS của trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam.
Với những trường này, Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội yêu cầu nhà trường lựa chọn thời gian kiểm tra, đánh giá năng lực phù hợp. Đồng thời, báo cáo phòng Giáo dục và Đào tạo trình UBND quận, huyện, thị xã phê duyệt.