Thay đổi ở mùa này là chỉ có 1 HLV chính thức ở mỗi đội. Nhưng ở mỗi tập phát sóng của mùa hai, bốn huấn luyện viên của Tiếu lâm tứ trụ nhí mùa 2 là nghệ sĩ Hoàng Mèo, Minh Trọng, Huỳnh Tiến Khoa và Bình Tinh sẽ có thể mời thêm một vị khách mời đặc biệt xuất hiện cùng hỗ trợ và hướng dẫn cho các bé ở mỗi vòng thi.
Là nữ huấn luyện viên duy nhất trong chương trình, nghệ sĩ Bình Tinh chia sẻ: “Tôi cảm thấy đây là một chương trình thú vị, các em trong chương trình nhỏ tuổi nhưng rất tài năng. Mặc dù là nữ huấn luyện duy nhất nhưng tôi không hề thấy áp lực, mà ngược lại tôi thấy mình có được ưu thế hơn khi dễ dàng giao lưu, chia sẻ với các bé, cũng như tôi có thế mạnh riêng của mình để hướng dẫn các em”.
Tiếu lâm tứ trụ nhí mùa 2 trải qua 13 tập tranh tài với tập 1,2 là vòng tuyển chọn; các tập tiếp theo là những đêm thi chủ đề để mỗi đội tìm ra 1 thí sinh xuất sắc nhất bước vào đêm chung kết xếp hạng. Tổng giải thưởng chương trình vô cùng hấp dẫn lên đến 550 triệu đồng. Đội về nhất nhận được 150 triệu đồng, đội về nhì nhận được 100 triệu đồng, đồng hạng ba mỗi đội sẽ được 50 triệu đồng và còn 12 giải nhất tuần trị giá 20 triệu đồng/giải. Giải thưởng được phân chia 50% cho thí sinh và 50% cho huấn luyện viên.
