Theo cáo trạng, Shibuya đã bắt cóc bé Linh bằng ô tô vào sáng 24/3/2017 và xâm hại cô bé trước khi bóp cổ và bỏ xác lại gần một con mương thoát nước ở thành phố Abiko, tỉnh Chiba. Trong phần trình bày mở đầu tại tòa, phía công tố chỉ ra mẫu ADN của bé Linh trùng với mẫu phát hiện từ vết máu trên xe riêng của bị cáo Shibuya cũng như từ đồ cắm trại của ông ta.
Tuy nhiên, nghi phạm Shibuya đã phủ nhận mọi cáo buộc. "Mọi chuyện hoàn toàn khác. Cáo buộc của công tố viên là không đúng sự thật và cưỡng ép. Tôi không liên quan đến sự việc. Tôi khẳng định tôi hoàn toàn vô tội", Shibuya nói tại tòa.
Phiên tòa dự kiến kết thúc tranh tụng và bên công tố sẽ đề nghị mức án vào ngày 18/6. Trả lời phỏng vấn báo giới, anh Lê Văn Hào, cha của bé Nhật Linh, bày tỏ mong muốn sự thật nhanh chóng được làm sáng tỏ. Gia đình bé Linh hy vọng tòa án sẽ "bảo vệ trẻ em và thực thi công lý" bằng cách đưa ra hình phạt nặng nhất dành cho bị cáo Shibuya.